突然面临生死考验的地下基地群全力为生存而战，好在基地群中拥有完善的应急系统，第一山地师在付出惨重代价后最终将变异人暴动镇压下去。诡异地爆发在高级指挥部门的灾难使第一山地师失去了包括师长在内的大批高级将领，13219名军人和25760名平民不幸在灾难中丧失了生命，悲痛的气息肆虐着整个一二五基地群，随处可见恸哭的人们，几座焚烧炉不眠不休地持续运转，将死无全尸的变异人化为灰烬。

惊魂未定的人们还没平复自己的情绪，一个更惨烈的消息将他们的情绪继续拉向万丈深渊的底部。总统、司法院、立法院、行政院、监察院和考试院所在的一二四基地群发生无法控制的变异人灾难，第十一机步师镇压失败，全军覆灭。殉职之前的总统签发最后一条命令，授予其余的方舟基地内四个作战师的师长军政大权，要求四位师长依托方舟基地在全国筹建四个战区，以第一战区为首，作为日后恢复国统和法统的最后力量。立法院公布新的《战时动员戡乱条款》，进一步加强国家的威权政治，强化戒严状态，国防部发布最后的人事任命，确定各战区主官的接替顺序。随后，在一场规模庞大的爆炸中，一二四基地群彻底终止了作为诺亚方舟的使命。

“一二六、一二七和一二八基地群一直没有回应我们的联络，方舟基地的位置并不在军方网络内，总统又没能来得及将坐标传输给我们，没法派人去查看这四个基地群的状态，现在只能假设全国仅剩下一二五基地尚存。”被提升为二级上将并奉命接管第一山地师和一二五基地指挥权的谢笠没有任何喜悦的情绪。“老谢，看来总统遗命中依托方舟基地建立四个战区的计划已经无法完成，根据最高命令的第九条款，我们只能先筹建第一战区，再由第一战区掌握全国军队，恢复国统和法统。另外，研究院的翁博士要求当面做一个V的报告，我们最好去听听他的研究成果。”同样挂着二级上将军衔的凌宇低声道。

“上将，据我们推测，某种情况下，病毒的潜伏期可以超过三个月，所以才会出现地下基地的疫情。”会议室内，一位胸前别着“翁源智博士”的科学家作着关于病毒的研究报告，“我们研究了一些被变异人体液侵入血液后的病例。这些病例中，病毒的潜伏期极短，被变异人体液沾染的患者会在几个小时内进入病发状态。对于这一反常现象，我们还没有研究出结果。”

停顿了几秒，翁博士继续道：“现在V病毒的毒株已经拿到，实验室目前正在用鸡蛋胚胎制造疫苗。上将，”他强调道：“根据现有的医学理论推测，由于人体免疫系统的存在，单纯的接触和飞沫传播，V病毒不会成功感染所有人，但我仍然建议全面检查基地人员的血液，以免再发生悲剧。”“之前我们过分关注体液传播的潜伏期，最终得出了错误的结论，认为V的潜伏期极短，所以造成了地下基地的灾难。”翁博士最后自责道。